Vários poluentes e fontes de poluição ameaçam o equilíbrio e a saúde ambiental visto nos metais em regiões de mineração, pesticidas na produção de cereais e frutas cítricas além de resíduos de indústrias químicas e petroquímicas. A contaminação residual pelo mercúrio decorrente mineração do ouro ou a cor turquesa dos rios pelo derrame de pirita na mineração são exemplos da detecção quimica de elementos minerais contaminantes. Estudos mostram efeitos biológicos da poluição em diferentes animais sentinelas que habitam regiões afetadas, ou, os mais sensíveis aos efeitos danosos servindo de alerta à prováveis acidentes de contaminação. Daí, diferentes bioindicadores avaliarem diversos ecossistemas como os efeitos do pesticida modelo DDE, subproduto do DDT, nos testículos de roedores existentes em pântanos. O principal derivado do DDT é um poluente persistente associado ao estresse oxidativo e várias alterações metabólicas como a carbonilação e fosforilação de proteínas, reduzidas nos testículos de camundongos, que expostos ao DDT são relacionadas à função sexual em roedores. O caranguejo vermelho americano existente em cursos de água doce e a coquina de lama presente no estuário do rio Guadalquivir na Europa, mostram efeitos recurrentes dos pesticidas. Respostas biológicas a nível bioquímico permitiram avaliar evolução ambiental da área ao longo do tempo, bem como recuperação pós desastres decorrentes da atividade de mineração.
Entre os organismos que habitam a Terra, a maior diversidade é encontrada no universo microscópico. Microrganismos mostram-se presentes desde o início da vida permanecendo até após o desaparecimento da humanidade. Pela grande plasticidade e capacidade de adaptação genética, micróbios colonizaram sem exceção todos os ecossistemas possíveis no planeta incluindo ambientes extremos. Em um grama de solo há 100 mil micróbios/m3 de ar e 10 mil/ml de água, interferindo com subprodutos de ações humanas. Daí microrganismos terem grande potencial como indicadores no diagnóstico ambiental, amplamente distribuídos, envolvidos nos ciclos biogeoquímicos dos principais elementos, ou, carbono, nitrogênio, fósforo e enxofre, na função dos ecossistemas, na degradação e imobilização de poluentes.
Moral da Nota: os micróbios são especialmente sensíveis às condições ambientais. Diferentes técnicas analisam diferentes biomoléculas, DNA e proteínas, globalmente avaliando mudanças na diversidade microbiana e nos processos metabólicos causados pela poluição. Espécies invasoras ameaçam Parques Nacionais inseridas em mudanças climáticas, na contaminação química do plástico e na ameaça silenciosa dos microplásticos poluidores dos solos.